Estructura i funció de la cromatina
Ferran Azorín
Investigador Principal
Professor (IBMB-CSIC)
Tel Oficina : +34 93 403 49 58
Tel Lab : +34 93 403 49 60
correu-e : ferran.azorin
irbbarcelona.org
Introducció
Les funcions genòmiques no tenen lloc en l’ADN nu, sinó en la cromatina. En els darrers anys, hem pogut aprofundir considerablement en el coneixement de les funcions de la cromatina, gràcies a la identificació dels components i mecanismes que modifiquen les seves propietats estructurals i funcionals com, per exemple, els complexos remodeladors, les modificacions de les histones (acetilació, metilació...) i els enzims corresponents, les variants d’histones amb localitzacions cromàtiques específiques, proteïnes estructurals no-histona que contribueixen a les propietats estructurals de regions específiques de cromatina (heterocromatina), entre d’altres. La nostra recerca està centrada en l’estudi de les bases moleculars de la funció de la cromatina i la seva regulació.
Camps d'Investigació
- Estructura i funció del centròmer: la segregació cromosòmica.
- Regulació epigenètica de les funcions genòmiques.
- Estudi de les propietats estructurals i funcionals de l’heterocromatina.
- Estudi dels mecanismes epigenètics implicats en la regulació de l’expressió dels gens homeòtics a Drosophila.
Línies de Recerca
I. Estructura i funció del centròmer: la segregació cromosòmica
Estudiem la determinació de les propietats estructurals i funcionals de la cromatina centromèrica i telomèrica, així com la seva contribució a la segregació de cromosomes.
Els nostres objectius específics són:
- Realitzar una anàlisi estructural i funcional de les variants de la histona centromèrica H3 i del seu paper en l’assemblatge de cinetocors.
- Analitzar la contribució de la via de l’RNAi en l’establiment i el manteniment de l’heterocromatina.
- Estudiar els determinants moleculars de la interacció de les proteïnes HP1 amb la cromatina.
- Analitzar la contribució de les proteïnes amb domini multi-KH a les propietats estructurals i funcionals de l’heterocromatina cèntrica i determinar la seva participació en la condensació i segregació de cromosomes.
II. Regulació epigenètica de la funció i estructura de la cromatina
En aquest punt, dirigim la nostra recerca sobre la contribució de les modificacions d’histones a la regulació de l’estructura i funció de la cromatina.
Els nostres objectius específics són:
- Determinar el patró de modificacions post-traduccionals de la histona H1 i analitzar la seva contribució a les propietats estructurals i funcionals de la cromatina.
- Caracteritzar funcionalment les metiltransferases d’histones.
- Realitzar la caracterització estructural i funcional dels factors cromàtics que reconeixen específicament les histones metilades.
III. Regulació epigenètica de l’expressió de gens homeòtics a Drosophila.
L’estructura de la cromatina té un paper crucial en la regulació de l’expressió gènica. En aquest context, dirigim els nostres esforços a determinar la contribució de l’estructura de la cromatina a l’establiment i manteniment del patró d’expressió dels gens homeòtics a Drosophila.
Els nostres objectius específics són:
- Analitzar la contribució de l’estructura de la cromatina a la regulació funcional del complex bithorax.
- Estudiar el paper de la proteïna dSap18 en la regulació de les funcions del Fab-7.
Finançament
Aquest grup de recerca rep finançament de les següents institucions:
- Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento
- Comissió Europea FP6
Més informació
Estructura i funció de la cromatina
Drosophila HP1c isoform interacts with the zinc-finger proteins WOC and relative-of-WOC (ROW) to regulate gene expression
Font-Burgada J, Rossell D, Auer H and Azorín F
Genes Dev, 22 (21), 3007-3023 (2008)
Characterization of new regulatory elements within the Drosophila bithorax complex
Pérez-Lluch S, Cuartero S, Azorín F and Espinàs ML
Nucleic Acids Res [Epub ahead of print] (2008)
The fission yeast homologue of CENP-B, Abp1, regulates directionality of mating-type switching
Aguilar-Arnal L, Marsellach FX and Azorín F
EMBO J, 27 (7), 1029-1038 (2008)
Characterization of Drosophila melanogaster JmjC+N histone demethylases
Lloret-Llinares M, Carré C, Vaquero A, de Olano N and Azorín F
Nucleic Acids Res, 36 (9), 2852-2863 (2008)
Intracellular targeting of telomeric retrotransposon Gag proteins of distantly related Drosophila species
Casacuberta E, Azorín F and Pardue ML
Proc Natl Acad Sci USA, 104 (20), 8391-8396 (2007)
RNA is an integral component of chromatin that contributes to its structural organization
Rodríguez-Campos A and Azorín F
PLoS ONE, 2 (11), e1182 (2007)
General, negative feedback mechanism for regulation of Trithorax-like gene expression in vivo: new roles for GAGA factor in flies
Bernués J, Piñeyro D and Kosoy A
Nucleic Acids Res, 35 (21), 7150-7159 (2007)
SIRT1 regulates the histone methyl-transferase SUV39H1 during heterochromatin formation
Vaquero A, Scher M, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Serrano L and Reinberg D
Nature, 450 (7168), 440-444 (2007)
Drosophila dSAP18 is a nuclear protein that associates with chromosomes and the nuclear matrix, and interacts with pinin, a protein factor involved in RNA splicing
Costa E, Canudas S, Garcia-Bassets I, Pérez S, Fernández I, Giralt E, Azorín F and Espinás ML
Chromosome Res, 14 (5), 515-526 (2006)
Proteolysis restricts localisation of CID, the centromere-specific histone H3 variant of Drosophila, to centromeres
Moreno-Moreno O, Torras-Lort M and Azorín F
Nucleic Acid Res (online publication) (2006)
SirT2 is a histone deacetylase with preference for histone H4 Lys 16 during mitosis
Vaquero A, Scher M, Lee DH, Sutton A, Cheng HL, Alt F, Serrano L, Sternglaz R and Reinberg D
Genes Dev, 20 (10), 1256-1261 (2006)
The multi-KH-domain protein of Saccharomyces cerevisiae contributes to the regulation of telomeric silencing
Marsellach FX, Huertas D and Azorín F
J Biol Chem, 281 (26), 18227-18235 (2006)
RNA interference has a role in regulating Drosophila telomeres
Casacuberta E and Pardue ML
Genome Biol, 7 (5), 220 (2006)
The GAGA protein of Drosophila is phosphorylated by CK2
Bonet C, Fernández I, Aran X, Bernués J, Giralt E and Azorín F
J Mol Biol, 351 (3), 562-572 (2005)
dSAP18 and dHDAC1 contribute to the functional regulation of the Drosophila Fab-7 element
Canudas S, Fanti L, Pimpinelli S, Singh N, Hanes S, Azorín F and Espinás ML
Nucleic Acids Res, 33 (15), 4857-4864 (2005)
Drosophila DDP1, a multi KH-domain protein, contributes to centromeric silencing and chromosome segregation
Huertas D, Cortés A, Casanova J and Azorín F
Curr Biol, 14 (18), 1611-1620 (2004)
Repression by TTK69 of GAGA-mediated activation occurs in the absence of TTK69 binding to DNA and solely requires the contribution of the POZ/BTB domain of TTK69
Pagans S, Piñeyro D, Kosoy A, Bernués J and Azorín F
J Biol Chem, 279 (11), 9725-9732 (2004)
Analysing the contribution of nucleic acids to the structure and properties of centric heterochromatin
Cortés A, Huertas D, Marsellach FX, Ferrer-Miralles N, Ortiz-Lombardía M, Fanti L, Pimpinelli S, Piña B and Azorín F
Genetica, 117 (2-3), 117-125 (2003)
Functional characterization of the human phosphodiesterase 7A1 promoter
Torras-Llort M and Azorín F
Biochem J, 373 (Pt 3), 835-843 (2003)
Estructura i funció de la cromatina
Ferran Azorín
Investigador Principal
Professor (IBMB-CSIC)
Tel Oficina : +34 93 403 49 58
Tel Lab : +34 93 403 49 60
correu-e : ferran.azorin
irbbarcelona.org
Senior Associate researcher
Jordi Bernués
tel +34 93 403 49 60
jordi.bernues
irbbarcelona.org
Maria Lluïsa Espinás
tel +34 93 403 49 62
maria.espinas
irbbarcelona.org
Associate researcher
Elena Casacuberta
tel +34 93 403 49 62
elena.casacuberta
irbbarcelona.org
Alejandro Vaquero
tel +34 93 403 49 63
alejandro.vaquero
irbbarcelona.org
Postdoctoral fellow
Francesc-Xavier Marsellach
tel +34 93 403 49 63
francesc.marsellach
irbbarcelona.org
Olga Moreno
tel +34 93 403 49 63
olga.moreno
irbbarcelona.org
Mónica Torras
tel +34 93 403 49 63
monica.torras
irbbarcelona.org
Clèment Carrè
Martí Badal Soler
tel +34 93 403 49 63
marti.badal
irbbarcelona.org
PhD Students
Lorena Aguilar
tel +34 93 403 49 63
lorena.aguilar
irbbarcelona.org
Marta Batlle
tel +34 93 403 49 63
marta.batlle
irbbarcelona.org
Sonia Medina
tel +34 93 403 49 63
sonia.medina
irbbarcelona.org
Marta Lloret Llinares
tel +34 93 403 49 63
marta.lloret
irbbarcelona.org
Joan Font
tel +34 93 403 49 63
joan.font
irbbarcelona.org
Rute Sousa
tel +34 93 403 49 63
rute.sousa
irbbarcelona.org
Olivera Vujatovic
tel +34 93 403 49 63
olivera.vujatovic
irbbarcelona.org
Sergi Cuartero
tel +34 93 403 49 63
sergio.cuartero
irbbarcelona.org
David Piñeyro
tel +34 93 403 49 63
david.pineyro
irbbarcelona.org
Marta Blanch
tel +34 93 403 49 63
marta.blach
irbbarcelona.org
Elisabet Costa
tel +34 93 403 49 63
elisabet.costa
irbbarcelona.org
Xavier Aran
tel +34 93 403 49 63
xavier.aran
irbbarcelona.org
Research assistant
Esther Fuentes
tel +34 93 403 49 64
esther.fuentes
irbbarcelona.org
Carles Bonet
carles.bonet
irbbarcelona.org
Gemma Mollà
tel +34 93 403 49 63
gemma.valles
irbbarcelona.org
Alicia Vera Cabanillas
tel +34 93 403 49 63
alicia.vera
irbbarcelona.org
Visiting student
Tomasso Cabaza
Pablo Sirkin
Nina Schuback
tel +34 93 403 49 63
nina.schuback
irbbarcelona.org
Estructura i funció de la cromatina