Las infecciones producidas por bacterias están aumentando en todo el mundo, incluso en Europa. La principal razón es la pérdida de eficacia de los antibióticos con el consecuente incremento de casos de meningitis, tuberculosis y un buen número de enfermedades respiratorias, urinarias y gastrointestinales, especialmente graves para los pacientes de los hospitales, que tienen las defensas bajas. Las bacterias gram negativas, una categoría de microbios más difíciles de tratar porque tienen una doble membrana que los recubre, han desarrollado resistencia a la mayoría de antibióticos disponibles. Contra este tipo de bacterias está dirigido el proyecto AntiPathoGN, financiado con seis millones de euros por la Unión Europea. AntiPathoGN está coordinado por la Universidad Autónoma de Barcelona (UAB) y aglutina once centros, entre los que se encuentra el Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona).

"Encontrar nuevos agentes antiinfecciosos contra las bacterias gram negativas es imperioso porque a la resistencia a los antibióticos se le suma que no hay ningún nuevo fármaco en desarrollo para los próximos años", explica el coordinador del proyecto Xavier Daura, de la UAB. Para poder prevenir y tratar las infecciones es necesario comprender los mecanismos moleculares que determinan la virulencia del microorganismo. El proyecto AntiPathoGN aplicará, entre otras técnicas, la bioinformática para detectar las interacciones entre las moléculas que son imprescindibles para la supervivencia bacteriana y también las interacciones entre aquellas que les confieren resistencia frente a los antibióticos.

El gran avance tecnológico ha posibilitado el desarrollo de la genómica y ha puesto a disposición de la comunidad científica un gran abanico de bases de datos que permiten estudiar la enorme diversidad de genomas bacterianos. AntipathoGN aglutina expertos en biología de sistemas, interactómica comparativa, microbiología, biología estructural y desarrollo de fármacos. Patrick Aloy, investigador ICREA en el IRB Barcelona, es uno de los especialistas en interactómica, la metodología estrella del proyecto, disciplina que estudia las relaciones entre las proteínas de un genoma completo. "Disponer de los interactomas de distintas bacterias nos permitirá detectar aquellas piezas más vulnerables en su biología. Además, la comparación de los distintos mapas de proteínas nos indicará dianas potenciales tanto para especies concretas como para el conjunto de bacterias gram negativas", explica Aloy.

AntiPathoGN estudiará cuatro de las bacterias gram negativas más insidiosas: Pseudomonas aeruginosa, Helicobacter Pylori, Acinetobacter baumannii y Escherichia coli. Por ejemplo, P. aeruginosa es una bacteria denominada “oportunista” porque raramente infecta a personas sanas sino a individuos con el sistema inmunológico débil, como a enfermos de fibrosis quística, sida o cáncer. Un dato notable es que las infecciones hospitalarias de P. aeruginosa son mortales en más del 40% de los casos. Otro ejemplo es un cierto tipo de E. coli, la cepa O157:H7, que causa graves y en ocasiones letales infecciones intestinales a través de alimentos contaminados.

Por países, en el proyecto AntiPathoGN participan España con seis laboratorios, Alemania con tres y Francia y Bulgaria con uno, y de estos 11, siete son empresas.