Un equipo de científicos del programa conjunto formado por el Barcelona Supercomputing Center (BSC) y el Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona) han revelado la existencia de un código en el genoma, desconocido hasta ahora, que juega un papel clave en la regulación de la expresión génica, es decir en el mecanismo que dicta cuándo y en qué tejido se deben expresar los genes. Este descubrimiento ha sido liderado por los investigadores Modesto Orozco y David Torrents, del programa conjunto IRB Barcelona - BSC, en colaboración con el equipo de Francisco Javier Luque, de la Universidad de Barcelona. En el estudio también han participado miembros del Instituto Nacional de Bioinformática (INB).

Gracias a las investigaciones llevadas a cabo durante el pasado año y publicadas en el último número de Genome Biology, los científicos han podido localizar las regiones en el genoma, denominadas promotores, encargadas de controlar la expresión de los genes. “Localizar estas regiones promotoras es una tarea muy difícil porque presentan pocas señales de secuencia definidas y el código que emplea la naturaleza para detectarlas es muy complejo”, señala Modesto Orozco, coordinador del programa conjunto IRB Barcelona - BSC. Este ha-llazgo es de vital importancia para los diferentes campos de la biología: molecular, evolutiva y biomédica.

Además, el descubrimiento de estas regiones promotoras es un primer paso para empezar a entender mejor la estructura del ADN y para conocer las bases moleculares de ciertas enfermedades, como por ejemplo el cáncer. “Muchos tipos de cánceres se deben directa o indirectamente a una mala regulación de la expresión de unos genes determinados que controlan el crecimiento celular (oncogén). Para llegar a entender esta mala regulación, es necesario saber dónde se encuentran los promotores que los controlan”, afirma David Torrents, investigador principal del programa conjunto IRB Barcelona - BSC.

Los científicos han desarrollado estrategias para determinar las propiedades físicas del ADN a nivel genómico a través de cálculos de dinámica molecular, que son posibles gracias a la potencia computacional del superordenador MareNostrum, uno de los más potentes del mundo e instalado en Barcelona.

Acerca del programa conjunto IRB Barcelona - BSC

En septiembre de 2007, el IRB Barcelona y el BSC firmaron un convenio para la creación de un programa conjunto de investigación, cuya duración llega hasta diciembre de 2010. Este programa conjunto cuenta con un equipo de investigadores del departamento de Ciencias de la Vida del BSC y del programa de Biología Estructural y Computacional del IRB Barcelona. Su principal objetivo es potenciar la investigación en biología computacional y favorecer las sinergias entre el IRB Barcelona y el BSC. El programa cuenta con un Comité Científico Asesor externo, que se encarga del seguimiento y evaluación de su actividad. Además, dispone de una Comisión de Seguimiento formada por dos representantes de cada entidad, cuyo objetivo es coordinar y analizar todas las actividades que se realizan. Las actividades conjuntas establecidas se financian con fondos aportados a partes iguales por ambas instituciones.

Artículo de referencia:
Determining promoter location based on DNA structure first-principles calculations.
Goñi JR, Pérez A, Torrents D, Orozco M.
Genome Biol. 2007 (e-pub ahead of print)