Estructura y función de la cromatina
Ferran Azorín
Jefe de Grupo
Professor (IBMB-CSIC)
Tel Oficina : +34 93 40 34958
Tel Lab : +34 93 403 49 64
correo-e : ferran.azorin
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Introducción
Las funciones genómicas no tienen lugar en el ADN desnudo, sino en la cromatina. En los últimos años hemos podido profundizar considerablemente en el conocimiento de las funciones de la cromatina, gracias a la identificación de los componentes y mecanismos que modifican sus propiedades estructurales y funcionales como, por ejemplo, los complejos remodeladores, las modificaciones de las histonas (acetilación, metilación…) y las enzimas correspondientes, las variantes de histonas con localizaciones cromáticas específicas, proteínas estructurales no-histona que contribuyen a las propiedades estructurales de regiones específicas de cromatina (heterocromatina), entre otras.
Nuestra investigación se centra en el estudio de las bases moleculares de la función de la cromatina y su regulación.
Áreas de interés científico
- Regulación epigenética de las funciones genómicas.
- Estructura y función del centrómero: la segregación cromosómica.
- Estudio de las propiedades estructurales y funcionales de la heterocromatina.
- Estudio de los mecanismos epigenéticos implicados en la regulación de la expresión de los genes homeóticos en Drosophila.
Líneas de Investigación
I. Estructura y función del centrómero: la segregación cromosómica
Estudiamos la determinación de las propiedades estructurales y funcionales de la cromatina centromérica y telomérica, así como su contribución a la segregación de cromosomas.
Nuestros objetivos específicos son:
- Realizar un análisis estructural y funcional de las variantes de la histona centromérica H3 y de su papel en el ensamblaje de cinetocoros.
- Analizar la contribución de la vía del RNAi en el establecimiento y en el mantenimiento de la heterocromatina.
- Estudiar los determinantes moleculares de la interacción de las proteínas HP1 con la cromatina.
- Analizar la contribución de las proteínas con dominio multi-KH a las propiedades estructurales y funcionales de la heterocromatina céntrica y determinar su participación en la condensación y segregación de cromosomas.
II. Regulación epigenética de la función y estructura de la cromatina
En este punto, dirigimos nuestra investigación a la contribución de las modificaciones de histonas a la regulación de la estructura y función de la cromatina.
Nuestros objetivos específicos son:
- Determinar el patrón de modificaciones post-traduccionales de la histona H1 y analizar su contribución a las propiedades estructurales y funcionales de la cromatina.
- Caracterizar funcionalmente las metiltransferasas de histonas.
- Realizar la caracterización estructural y funcional de los factores cromáticos que reconocen específicamente las histonas metiladas.
III. Regulación epigenética de la expresión de genes homeóticos en Drosophila.
La estructura de la cromatina tiene un papel crucial en la regulación de la expresión génica. En este contexto, dirigimos nuestros esfuerzos a determinar la contribución de la estructura de la cromatina al establecimiento y mantenimiento del patrón de expresión de los genes homeóticos en Drosophila.
Nuestros objetivos específicos son:
- Analizar la contribución de la estructura de la cromatina a la regulación funcional del complejo bithorax.
- Estudiar el papel de la proteína dSap18 en la regulación de las funciones del Fab-7.
Financiación
Este grupo de investigación recibe financiación de las siguientes instituciones:
- Programa Nacional de Promoción General del Conocimiento
- Comisión Europea FP6
Más información
Estructura y función de la cromatina
A conserved arginine-rich motif within the hypervariable N-domain of Drosophila centromeric histone H3 (CenH3CID) mediates BubR1 recruitment
Torras-Llort M, Medina-Giró S, Moreno-Moreno O and Azorín F.
PLoS One, 5 (10)-e13747 (2010)
Drosophila vigilin, DDP1, localises to the cytoplasm and associates to the rough-endoplasmic reticulum
Batlle M, Marsellach FX, Huertas D and Azorín F
Biochim Biophys Acta. (In press) (2010)
Acetylation of GAGA factor modulates its interaction with DNA
Aran-Guiu X, Ortiz-Lombardía M, Oliveira E, Bonet Costa C, Odena MA, Bellido D, Bernués J.
Biochemistry, 49 (43), 9140-9150 (2010)
A new aminoacyl-tRNA synthetase-like protein in insecta with an essential mitochondrial function
Guitart T, Leon Bernardo T, Segalés J, Stratmann T, Bernués J and Ribas de Pouplana L.
J Biol Chem. (In press) (2010)
Focus on the centre: the role of chromatin on the regulation of centromere identity and function
Torras-Llort M, Moreno-Moreno O and Azorín F
EMBO J, 28 (16), 2337-2348 (2009)
Drosophila HP1c isoform interacts with the zinc-finger proteins WOC and relative-of-WOC (ROW) to regulate gene expression
Font-Burgada J, Rossell D, Auer H and Azorín F
Genes Dev, 22 (21), 3007-3023 (2008)
Characterization of Drosophila melanogaster JmjC+N histone demethylases
Lloret-Llinares M, Carré C, Vaquero A, de Olano N and Azorín F
Nucleic Acids Res, 36 (9), 2852-2863 (2008)
The fission yeast homologue of CENP-B, Abp1, regulates directionality of mating-type switching
Aguilar-Arnal L, Marsellach FX and Azorín F
EMBO J, 27 (7), 1029-1038 (2008)
Characterization of new regulatory elements within the Drosophila bithorax complex
Pérez-Lluch S, Cuartero S, Azorín F and Espinàs ML
Nucleic Acids Res, 36 (21), 6926-6933 (2008)
Activation properties of GAGA transcription factor
Vaquero A, Blanch M, Espinás ML and Bernués J
Biochim Biophys Acta, 1779 (5), 312-317 (2008)
Intracellular targeting of telomeric retrotransposon Gag proteins of distantly related Drosophila species
Casacuberta E, Azorín F and Pardue ML
Proc Natl Acad Sci USA, 104 (20), 8391-8396 (2007)
RNA is an integral component of chromatin that contributes to its structural organization
Rodríguez-Campos A and Azorín F
PLoS ONE, 2 (11), e1182 (2007)
General, negative feedback mechanism for regulation of Trithorax-like gene expression in vivo: new roles for GAGA factor in flies
Bernués J, Piñeyro D and Kosoy A
Nucleic Acids Res, 35 (21), 7150-7159 (2007)
Drosophila dSAP18 is a nuclear protein that associates with chromosomes and the nuclear matrix, and interacts with pinin, a protein factor involved in RNA splicing
Costa E, Canudas S, Garcia-Bassets I, Pérez S, Fernández I, Giralt E, Azorín F and Espinás ML
Chromosome Res, 14 (5), 515-526 (2006)
Proteolysis restricts localisation of CID, the centromere-specific histone H3 variant of Drosophila, to centromeres
Moreno-Moreno O, Torras-Lort M and Azorín F
Nucleic Acid Res, 34 (21), 6247-6255 (2006)
The multi-KH-domain protein of Saccharomyces cerevisiae contributes to the regulation of telomeric silencing
Marsellach FX, Huertas D and Azorín F
J Biol Chem, 281 (26), 18227-18235 (2006)
The GAGA protein of Drosophila is phosphorylated by CK2
Bonet C, Fernández I, Aran X, Bernués J, Giralt E and Azorín F
J Mol Biol, 351 (3), 562-572 (2005)
dSAP18 and dHDAC1 contribute to the functional regulation of the Drosophila Fab-7 element
Canudas S, Fanti L, Pimpinelli S, Singh N, Hanes S, Azorín F and Espinás ML
Nucleic Acids Res, 33 (15), 4857-4864 (2005)
Drosophila DDP1, a multi KH-domain protein, contributes to centromeric silencing and chromosome segregation
Huertas D, Cortés A, Casanova J and Azorín F
Curr Biol, 14 (18), 1611-1620 (2004)
Repression by TTK69 of GAGA-mediated activation occurs in the absence of TTK69 binding to DNA and solely requires the contribution of the POZ/BTB domain of TTK69
Pagans S, Piñeyro D, Kosoy A, Bernués J and Azorín F
J Biol Chem, 279 (11), 9725-9732 (2004)
Analysing the contribution of nucleic acids to the structure and properties of centric heterochromatin
Cortés A, Huertas D, Marsellach FX, Ferrer-Miralles N, Ortiz-Lombardía M, Fanti L, Pimpinelli S, Piña B and Azorín F
Genetica, 117 (2-3), 117-125 (2003)
Functional characterization of the human phosphodiesterase 7A1 promoter
Torras-Llort M and Azorín F
Biochem J, 373 (Pt 3), 835-843 (2003)
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