Molecular Modelling and Bioinformatics news

<p>3D representation of a human DNA fragment (Copyright: Marc Martí-Renom, CNAG-CRG)</p>
9 Dic 2015

El IRB Barcelona coordina un proyecto Horizon2020 en bioinformática para poner orden en el campo emergente de la genómica 3D.

La genómica 3D ofrece información de la estructura que adopta el ADN replegado dentro de la célula, como varía en el tiempo y por respuesta a condiciones celulares.

Modesto Orozco, coordinador: "La visión 3D nos permitirá relacionar mejor los cambios en el genoma con las patologías asociadas, porque con la información 1D, a pesar de ser relevante, no es suficiente."

El objetivo a tres años vista es ofrecer un paquete de métodos y bases de datos integradas para guardar y procesar los estudios en genómica 3D.

El consorcio europeo lo comprenden seis instituciones internacionales líderes en el desarrollo de metodología y visualización de genómica 3D.

 

19 Nov 2015

Diversos medios han explicado el lanzamiento de la plataforma de simulaciones de ADN creada por el laboratorio de Modesto Orozco del IRB Barcelona en colaboración con diversos laboratorios internacionales.

El trabajo publicado en Nature Methods, ofrece acceso libre a través del web: http://mmb.irbbarcelona.org/ParmBSC1/
 

<p>Plasmid DNA simulation (P Dans. IRB Barcelona)</p>
17 Nov 2015

El método de simulación desarrollado en el laboratorio de Modesto Orozco permite estudiar cambios estructurales del ADN y su interacción con proteínas y fármacos con una “exactitud nunca antes conseguida”.

Todas las simulaciones y su análisis están alojados en la primera plataforma de simulaciones atomísticas de ácidos nucleicos desarrollada hasta la fecha.

La plataforma es libre y accesible a toda la comunidad científica dentro de la infraestructura del Instituto Nacional de Bioinformática y la red europea ELIXIR-Excellerate.

Entender mejor cómo el ADN es reconocido por proteínas que modulan su función, o por los fármacos que se le unen para ejercer su efecto terapéutico, son algunas de las utilidades del nuevo método, que permitirá avanzar en la comprensión de la funcionalidad biológica del ADN.

16 Nov 2015

El blog de divulgación científica Sharp Minds publica una entrevista con Modesto Orozco sobre sus motivaciones y el trabajo que hace en el IRB Barcelona en bioinformática y supercomputación, campo en el cual es referente internacional.

23 Oct 2015

El Instituto Nacional de Bioinformática (INB) actúa como nodo científico español. Lo componen instituciones de primer nivel como son el CNIO, el CRG, la Universidad Pompeu Fabra, el IRB Barcelona y el BSC-CNS.

<p>Inntags is a new tool for protein tagging (Image: Dr Aldea's laboratory)</p>
1 Sep 2015

Un estudio realizado en colaboración con el CSIC, el IRB Barcelona, ​​el BSC y la UB ofrece un nuevo método para hacer un seguimiento más limpio de proteínas dentro de las células

Las proteínas diana marcadas con inntags no muestran perturbaciones detectables de función ni localización

31 Ago 2015

La publicación Nature Middle East entrevista Modesto Orozco, jefe de grupo del IRB Barcelona, director de Ciencias de la Vida del BSC-CNS i catedrático de la UB. Orozco habla de la reciente publicación en Nature Methods del estudio sobre los inntags, un nuevo método desarrollado en colaboración con el CSIC, el IRB Barcelona, el BSC y la UB para estudiar las proteínas.

Ver la entrevista en Nature Middle East (en inglés)

11 Ago 2015

La revista Genetic Engineering & Biotechnology News (GEN), así como otros medios, publica una noticia sobre el artículo publicado recientemente en the Journal of the American Chemical Society (JACS) por un grupo de científicos liderado por Modesto Orozco, jefe de grupo del IRB Barcelona, director de Ciencias de la Vida del BSC-CNS y catedrático de la UB. Este grupo, compuesto por científicos del IRB Barcelona, la Universidad de Cambridge y la Universidad de Nueva York, ha descubierto el mecanismo molecular por el cual ciertas marcas epigenéticas influyen en la expresión de genes.

Leer el artículo en...

7 Ago 2015

El País recoge la noticia sobre el proyecto anunciado por el presidente de Estados Unidos, Barack Obama, para construir un superordenador capaz de realizar un trillón de cálculos por segundo. El artículo incluye declaraciones de Modesto Orozco, jefe de grupo del IRB Barcelona, director de Ciencias de la Vida del BSC-CNS y catedrático de la UB, que opina sobre las repercusiones que este proyecto podría tener en el campo de la investigación biomédica.

Leer el artículo en El País

<p>Histone tails (FreeStockImages)</p>
28 Jul 2015

Investigadores del IRB Barcelona descubren el mecanismo molecular por el que marcas epigenéticas influyen en la expresión de genes