Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
Julien Colombelli
Cap de Unitat
Tel Oficina : +34 93 40 20451
correu-e : julien.colombelli
irbbarcelona.org
Introducció
La Plataforma Científica de Microscòpia Digital Avançada es va inaugurar el gener del 2009. La plataforma posa a l’abast dels investigadors de l’IRB Barcelona, del Parc Científic de Barcelona (PCB) i dels científics visitants un ventall complert de sistemes i tècniques per a l'obtenció d'imatges a través dels diferents equips de microscòpia òptica. La plataforma permet l'accés les 24 hores del dia a microscopis òptics convencionals i confocals, i també proporciona assistència en tècniques avançades per a l’obtenció d'imatges així com el seu processament posterior i la correcta interpretació i presentació de les dades obtingudes.
En associació amb el PCB, la plataforma proporciona accés a temps complert a:
- Microscòpia convencional de transmissió i epifluorescència així com macroscòpia motoritzada de fluorescència
- Microscòpia espectral confocal, incloent FRAP, FRET, fotoactivació i microscòpia de multifotó
- Microscòpia de disc giratori confocal amb mòdul de FRAP integrat
- Microscòpia automatitzada de High Content Screening (rastreig d'alt contingut) amb microscòpia TIRF
- Nanocirurgia làser de cèl·lules vives i organismes combinada amb FRAP
- Estacions de treball pel processament de les imatges
L’ADM també està involucrada en el desenvolupament d'instrumental per la recerca i implementa la microscòpia de fluorescència obtinguda a partir de feixos de llum.
Per a més informació, contactar amb el mànager de la plataforma:
julien.colombelliirbbarcelona.com o microscopyirbbarcelona.com.
Més informació
Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
Serveis per als investigadors de l'IRB Barcelona i el PCB
- Microscòpia convencional de transmissió i de fluorescència. Camp clar, contrast de fase, contrast interdiferencial (DIC), camp fosc i imatges de fluorescència de múltiples colors en mostres fixades. Estereoscòpia de fluorescència per a la manipulació i la selecció de la mostra, imatges de camp ampli.
La instal·lació compta amb sis unitats: epifluorescència invertida (Nikon TE200), epifluorescència vertical (Nikon E600, E800, E1000), estereoscòpia de fluorescència (Leica) i macroscòpia de fluorescència (Olympus MVX10).
-
Microscòpia confocal espectral. Imatges 3D, 4D i 5D amb seccionament òptic, resolució i detecció espectral a mida, multiposició i cambra d'incubació per a cèl·lules vives.
La plataforma compta amb tres unitats: confocal invertit (Leica SP5 i Leica SP2) i confocal vertical (SPE).
-
Microscòpia multifotó. Imatges de fluorescència en profunditat i aplicacions multifotó. SP5 fet a mida amb un làser d'infrarojos ultracurt i polsant.
-
Microscòpia confocal de disc giratori. Obtenció ràpida d’imatges en 5D amb el sistema Andor Revolution, equipat amb càmera amb tecnologia EMCCD.
-
Microscòpia de fluorescència automatitzada de camp ampli amb rastreig d'alt contingut i TIRF.
La instal.lació té una unitat: Olympus CellR / ScanR. Microscopi invertit completament automatitzat per analitzar àrees grans. Plaques multipou i multiposició. Obtenció automatitzada d'imatges amb control de CO2 i temperatura. Il·luminació de fluorescència superestable per a l’anàlisi reproduïble d'imatges d'alt contingut. Microscòpia de fluorescència per reflexió total interna: imatges d'elevat contrast en la superfície.
-
Manipulació d’organismes i cèl·lules vives amb làser. FRAP i nanocirugia làser combinats en un microscopi de fluorescència de camp ampli per cercar patrons de FRAP i fluorescència, ablació cel·lular, ablació subcel·lular i microscòpia correlativa. Extracció de seccions de teixits, cèl·lules individuals o àrees de teixit preparades amb làser.
La plataforma té dues unitats: Zeiss Axiovert 200M, una plataforma de creació pròpia desenvolupada en col·laboració amb l'EMBL (European Molecular Biology Laboratory), i un microdissector Olympus MMI.
-
Estació de treball d'imatges: Processament i anàlisi de les imatges en estacions de treball de 32 i 64 bits equipats amb Imaris (Bitplane), Leica LAS AF, Igor Pro i solucions basades en ImageJ.
-
Sistema Demo. El microscopi espectral confocal A1R està instal·lat al nostre laboratori, en col·laboració amb Izasa SA. Per provar el sistema o obtenir més informació, contacteu-nos.
Properes aplicacions durant el 2010:
Microinjecció, Lightsheet Microscopy (SPIM)
Leyenda del Mapa 1: confocal SP5 + multifotón, 2: confocal SP2, 3: confocal SPE, 4: Microscopios de epifluorescencia, 5: Estereoscopio de fluorescencia, 6: Macroscopio de fluorescencia, 7: Disco giratorio confocal, 8: Microdisector, 9: Nanocirugía laser + FRAP, 10: Campo amplio automatizado para screening + TIRF, 11: Estación de trabajo para procesamiento de imágenes.
Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
Accés
Situats a la sala PB C1-B1, els nostres sistemes de microscòpia estan disponibles les 24 hores del dia i els 7 dies de la setmana per a tots els científics que treballen al Parc Científic de Barcelona.
Els científics i les empreses externes també poden accedir a les nostres instal·lacions. Per això cal enviar una sol·licitud oficial a microscopyirbbarcelona.org, que inclogui indicacions sobre l'objectiu i els principis dels experiments.
Política de facturació
Apliquem un 30% de descompte fora de l'horari d'oficina (de 8.00h a 9.00h i de 18.00h a 22:00) i un 50% per als treballs d'obtenció d'imatges durant la nit (de 22.00h a 08:00h en el sistema confocal).
Reserves
Tarifas 2010 (PDF)
Durant les hores d'oficina (de 9.00h a 18:00) l'accés als sistemes està restringit a un màxim de quatre hores per usuari. Aquesta restricció s'elimina quan la reserva està feta menys de 48 hores abans de l'experiment. El microscopi automatitzat d'Alt Contingut i el sistema d'obtenció d'imatges "Long Term live" (ScanR / CellR) no tenen restriccions de temps de reserva.
L'accés al nostre sistema de sol·licitud de reserves ha de ser concedit per algun membre de l’ADM per a cada nou usuari i cada sistema nou, a excepció de l’estereoscòpia de fluorescència (Lupa), que és accessible a tots. Es pot reservar a partir dels 14 dies d'antelació.
La cancel·lació tardana (amb menys de 24 hores d'antelació) donarà lloc a la facturació, si aquesta franja horària no la reserva cap altre usuari.
Alguns sistemes podrien tenir més restriccions en les reserves (per exemple: nombre d'hores disponible per grup, per setmana). Per tractar el tema de les restriccions o cobrir alguna necessitat especial contactar amb microscopyirbbarcelona.org.
Accés al formulari per reservar els instruments aquí.
És imprescindible acceptar un certificat SSL a l’hora d’accedir al sistema de reserves.
Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
© Photos by Gianluca Battista/Massimiliano MinocriCap de Unitat
Julien Colombelli
tel +34 93 40 20451
e-mail: julien.colombelliirbbarcelona.org
Tècnics d'Investigació Senior
Sébastien Tosi
tel +34 93 40 34647
e-mail: sebastien.tosiirbbarcelona.org
Tècnics d'Investigació
Anna Lladó
tel +34 93 40 34647
e-mail: anna.lladoirbbarcelona.org
Carmen Casal
tel +34 93 40 20499
e-mail: carmen.casalirbbarcelona.org
Lídia Bardia
tel +34 93 40 34647
e-mail: lidia.bardiairbbarcelona.org
Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
A novel laser nanosurgery approach supports de novo Golgi biogenesis in mammalian cells
Tängemo C, Ronchi P, Colombelli J, Haselmann U, Simpson JC, Antony C, Stelzer EH, Pepperkok R, Reynaud EG.
J Cell Sci, 124, 978-87 (2011)
Dynamic recruitment of licensing factor Cdt1 to sites of DNA damage
Roukos V, Kinkhabwala A, Colombelli J, Kotsantis P, Taraviras S, Nishitani H, Stelzer EHK, Bastiaens P, Lygerou Z.
Journal of Cell Science, 124, 422-434 (2011)
A macrodomain-containing histone rearranges chromatin upon sensing PARP1 activation
Timinszky G, Till S, Hassa PO, Hothorn M, Kustatscher G, Nijmeijer B, Colombelli J, Altmeyer M, Stelzer EH, Scheffzek K, Hottiger MO, Ladurner AG.
Nat Struct Mol Biol, 16 (9), 923-929 (2009)
Pulsed forces timed by a ratchet-like mechanism drive directed tissue movement during dorsal closure
Solon J, Kaya-Copur A, Colombelli J, Brunner D.
Cell, 137 (7), 1331-1342 (2009)
Mechanosensing in actin stress fibers revealed by a close correlation between force and protein localization
Colombelli J, Besser A, Kress H, Reynaud EG, Girard P, Caussinus E, Haselmann U, Small JV, Schwarz US, Stelzer EH.
J Cell Sci, 122 (Pt 10), 1665-1679 (2009)
A correlative light and electron microscopy method based on laser micropatterning and etching
Colombelli J, Tängemo C, Haselman U, Antony C, Stelzer EHK, Pepperkok R, Reynaud EG.
Methods Mol Biol., 457 (3), 13 (2008)
Tip-cell migration controls stalk-cell intercalation during Drosophila tracheal tube elongation
Caussinus E, Colombelli J, Affolter M.
Curr Biol., 18 (22), 1727-1734 (2008)
Mechanism of phototaxis in marine zooplankton
Jékely G, Colombelli J, Hausen H, Guy K, Stelzer E, Nédélec F, Arendt D.
Nature, 456 (7220), 395-399 (2008)
The SpoMBe pathway drives membrane bending necessary for cytokinesis and spore formation in yeast meiosis
Maier P, Rathfelder N, Maeder CI, Colombelli J, Stelzer EH, Knop M.
EMBO J., 27 (18), 2363-2374 (2008)
Investigating relaxation processes in cells and developing organisms: from cell ablation to cytoskeleton nanosurgery
Colombelli J, Reynaud EG, Stelzer EH.
Methods Cell Biol., 82, 267-291 (2007)
Three-dimensional laser microsurgery in light-sheet based microscopy (SPIM)
Engelbrecht CJ, Greger K, Reynaud EG, Krzic U, Colombelli J, Stelzer EH.
Opt Express, 15 (10), 6420-6430 (2007)
Dynein-mediated pulling forces drive rapid mitotic spindle elongation in Ustilago maydis
Fink G, Schuchardt I, Colombelli J, Stelzer E, Steinberg G.
EMBO J, 25 (20), 4897-4907 (2006)
Laser nanosurgery in cell biology
Colombelli J, Pepperkok R, Stelzer EH, Reynaud EG.
Med Sci (Paris), 22 (6-7), 651-658 (2006)
Spore number control and breeding in Saccharomyces cerevisiae: a key role for a self-organizing system
Taxis C, Keller P, Kavagiou Z, Jensen LJ, Colombelli J, Bork P, Stelzer EH, Knop M.
J Cell Biol., 171 (4), 627-640 (2005)
In vivo selective cytoskeleton dynamics quantification in interphase cells induced by pulsed ultraviolet laser nanosurgery
Colombelli J, Reynaud EG, Rietdorf J, Pepperkok R, Stelzer EH.
Traffic, 6 (12), 1093-1102 (2005)
Subcellular nanorsurgery with a pulsed subnanosecond UV-A laser
Colombelli J, Reynaud EG, Stelzer EHK.
Med Laser Appl., 20 (2005)
Ultraviolet diffraction limited nanosuregery of live biological tissues
Colombelli, J, Grill, S, Stelzer EHK.
Rev. Sci. Instr., 75 (2), 472-478 (2004)
Plataforma Científica de Microscopia Digital Avançada
RSS
facebook
YouTube
