Química combinatòria per al descobriment de nous compostos
Fernando Albericio
Investigador Principal
Professor (Organic Chemistry Dept. - UB)
Tel Oficina : +34 93 403 70 88
Tel Lab : +34 93 4037087-+34 93 4037069
correu-e : fernando.albericio
irbbarcelona.org
Introducció
En aquest grup s'utilitzen diferents eïnes de la ciència per a l’obtenció de dos nous tipus de compostos: els agents farmacològics (química terapèutica) i els polímers (nous materials). La nostra recerca implica dos elements complementaris: l’exploració de nous mètodes per a la preparació de quimioteques, i l’aplicació d’aquests mètodes en la cerca de nous compostos. En termes metodològics, treballem sobre suports, espaiadors, esquelets i estructures privilegiades que interaccionen amb dos o més receptors que no estan relacionats entre ells. En el camp de la química terapèutica, els nostres estudis es centren principalment en dos tipus de processos: el càncer i els desordres del sistema nerviós central.
Línies de Recerca
a) Síntesi i assignació estructural de pèptids amb bioactivitat
Pèptids marins. En aquest subprojecte, ens centrem en compostos estructuralment diferents: kahalalide F (actualment en assaigs clínics de fase III), ciclopèptids i pèptids amb azols concatenats. Els nostres interessos principals són: fer anàlegs dels compostos naturals per augmentar la potència de compostos naturals com ara el kahalalide F, la preparació de quimioteques anàlogues per millorar les propietats d’ADME (absorció, distribució, metabolisme i excreció) i el desenvolupament de metodologies sintètiques per a aquests compostos.
Vacunes peptídiques contra el càncer: aquest projecte dirigeix el desenvolupament racional de les vacunes sintètiques amb base de pèptids al tractament contra el melanoma. Per tal d’eliminar tumors i prevenir-ne l’expansió a altres òrgans (metàstasi), la vacuna contra el càncer ha de ser capaç d’estimular selectivament tant la resposta immunològica cel·lular (limfòcits T citotòxics) com la humoral (limfòcits B específics). La flexibilitat estructural de les vacunes de pèptids proposades facilitaria el desenvolupament d’estratègies terapèutiques específiques tant per al càncer com per als pacients. A més a més, una mateixa vacuna podria incloure diversos antígens, de tal manera que n’augmentaria l’eficàcia i es podria prevenir l’aparició de variants resistents.
b) Síntesi de sistemes poliheterocíclics de nitrogen
Els invertebrats marins, com les esponges, els tunicats, els ascídids i els coralls, ens han donat una bona reserva de nous compostos bioactius. Aquests compostos tenen una estructura característica sense precedents, i són molt actius contra diversos tipus de cèl•lules tumorals. Hem sintetitzat una gran quantitat d’alcaloides marins (llistats al final) en solució o en fase sòlida i, actualment, estem preparant una quimioteca de compostos que hi estan relacionats, de la mateixa manera que desenvolupem síntesis totals d’alcaloides marins nous. Per exemple: ascididemina, variolina B, pirrols derivats de lamellarina, lamellarines pentacícliques.
c) Síntesi en fase sòlida de quimioteques de compostos bioactius
Per mitjà de la química combinatòria preparem quimioteques de mida mitjana amb la intenció de millorar l’activitat, les propietats físiques i altres característiques dels compostos bioactius.
d) Noves resines i nous espaiadors
La síntesi en fase sòlida exigeix resines i espaiadors que estiguin adequadament funcionalitzats. Les resines, a més a més de servir de suport d’ancoratge material de l’esquelet i d’ajut per al creixement del compost, també han de servir de grup de protecció de la funcionalitat del material reactiu de partida. La nostra investigació en aquest camp inclou la modificació de resines comercialitzades i la síntesi de nous espaiadors.
e) La química d’hexafluoroacetona (HFA)
L’aplicació bifuncional de l’HFA com a grup de protecció i agent activador dels hidroxiàcids A és útil per a la preparació de depsipèptids i d’altres compostos d’interès biològic. Actualment estem preparant anàlegs depsipèptids de la cilengitida (Merck) així com quimioteques de pèptids i de compostos glicosídics.
Finançament
Aquest grup rep finançament de les institucions següents:
- Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología
- Fundació La Marató de TV3
- Secretaría de Estado de Cooperación Internacional (AECI)
Més informació
Química combinatòria per al descobriment de nous compostos
Synthesis of oligonucleotide derivatives using ChemMatrix supports
Mazzini S, García-Martin F, Alvira M, Aviñó A, Manning B, Albericio F and Eritja R
Chem Biodivers, 5 (1), 209-218 (2008)
Solid-phase synthesis of oligomers carrying several chromophore units linked by phosphodiester backbones
Aviñó A, Navarro I, Farrera-Sinfreu J, Royo M, Aymamí J, Delgado A, Llebaria A, Albericio F and Eritja R
Bioorg Med Chem Lett, 18 (7), 2306-2310 (2008)
Design, synthesis and antiproliferative properties of oligomers with chromophore units linked by amide backbones
Farrera-Sinfreu J, Aviñó A, Navarro I, Aymamí J, Beteta NG, Varón S, Pérez-Tomás R, Castillo-Avila W, Eritja R, Albericio F and Royo M
Bioorg Med Chem Lett, 18 (7), 2440-2444 (2008)
Understanding the mechanism of action of the novel SSAO substrate (C7NH10)6(V10O28).2H2O, a prodrug of peroxovanadate insulin mimetics
Yraola F, García-Vicente S, Marti L, Albericio F, Zorzano A and Royo M
Chem Biol Drug Des, 69 (6), 423-428 (2007)
Oral insulin-mimetic compounds that act independently of insulin
Garcia-Vicente S, Yraola F, Marti L, González-Muñoz E, García-Barrado MJ, Canto C, Abella A, Bour S, Artuch R, Sierra C, Brandi N, Carpene C, Moratinos J, Camps M, Palacín M, Testar X, Guma A, Albericio F, Royo M, Mian A and Zorzano A
Diabetes, 56 (2), 486 (2007)
New developments on the synthesis of oligonucleotide-peptide conjugates
Portela C, Mascareñas JL, Albericio F, Mazzini S, Caminal C, Ramos R, Ocampo SM and Eritja R
Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 26 (8-9), 963-967 (2007)
Solid-phase synthesis of oxathiocoraline by a key intermolecular disulfide dimer
Tulla-Puche J, Bayó-Puxan N, Moreno JA, Francesch AM, Cuevas C, Álvarez M and Albericio F
J Am Chem Soc, 129 (17), 5322-5323 (2007)
Smallest peptoids with antiproliferative activity on human neoplastic cells
Mas-Moruno C, Cruz LJ, Mora P, Messeguer A, Pérez-Payá E and Albericio F
J Med Chem, 50 (10), 2443-2449 (2007)
Novel ergopeptides as dual ligands for adenosine and dopamine receptors
Vendrell M, Angulo E, Casado V, Lluis C, Franco R, Albericio F and RoyoM
J Med Chem, 50 (13), 3062-3069 (2007)
Design and synthesis of indole-based peptoids as potent noncompetitive antagonists of transient receptor potential vanilloid 1
Quintanar-Audelo M, Fernández-Carvajal A, Van Den Nest W, Carreño C, Ferrer-Montiel A and Albericio F
J Med Chem, 50 (24), 6133-6143 (2007)
Inhibition of VAP1: quickly gaining ground as an anti-inflammatory therapy
Yraola F, Albericio F and Royo M
ChemMedChem, 2 (2), 173-174 (2007)
Synthesis and structure-activity relationship of cytotoxic marine cyclodepsipeptide IB-01212 analogues
Cruz LJ, Francesch A, Cuevas C and Albericio F
ChemMedChem, 2 (7), 1076-1084 (2007)
The synthesis of naturally occurring peptides and their analogs
Cupido T, Tulla-Puche J, Spengler J and Albericio F
Curr Opin Drug Discov Devel, 10 (6), 768-783 (2007)
Synthesis of IB-01211, a cyclic peptide containing 2,4-concatenated thia- and oxazoles, via Hantzsch macrocyclization
Hernández D, Vilar G, Riego E, Cañedo LM, Cuevas C, Albericio F and Alvarez M.
Org Lett, 9 (5), 809-811 (2007)
A nonacid degradable linker for solid-phase synthesis
Colombo A, De la Figuera N, Fernàndez JC, Fernández-Forner D, Albericio F and Forns P
Org Lett, 9 (21), 4319-4322 (2007)
p-Nitromandelic acid as a highly acid-stable safety-catch linker for solid-phase synthesis of peptide and depsipeptide acids
Isidro-Llobet A, Alvarez M, Burger K, Spengler J and Albericio F
Org Lett, 9 (8), 1429-1432 (2007)
Novel proton acceptor immonium-type coupling reagents: application in solution and solid-phase peptide synthesis
Ayman El-Faham and Fernando Albericio
Org Lett, 9 (22), 4475-4477 (2007)
Amide-to-ester substitution in coiled coils: the effect of removing hydrogen bonds on protein structure
Scheike JA, Baldauf C, Spengler J, Albericio F, Pisabarro MT andsch B
Angew Chem Int Ed Engl, 46 (41), 7766-7769 (2007)
ds-Oligonucleotide-peptide conjugates featuring peptides from the leucine-zipper region of Fos as switchable receptors for the oncoprotein Jun
Portela C, Albericio F, Eritja R, Castedo L and Mascareñas JL
ChemBiochem, 8 (10), 1110-1114 (2007)
Enolase as a plasminogen binding protein in Leishmania mexicana
Vanegas G, Quiñones W, Carrasco-López C, Concepción JL and Albericio F and Avilán L
Parasitol Res, 101 (6), 1511-1516 (2007)
Peptides and metallic nanoparticles for biomedical applications
Kogan MJ, Olmedo I, Hosta L, Guerrero AR, Cruz LJ and Albericio F
Nanomed, 2 (3), 287-306 (2007)
Solid-phase synthesis of sulfamate peptidomimetics
Farrera-Sinfreu J, Albericio F and Royo M
J Comb Chem, 9 (3), 501-506 (2007)
Advances in solid-phase cycloadditions for heterocyclic synthesis
Feliu L, Vera-Luque P, Albericio F and Alvarez M
J Comb Chem, 9 (4), 521-565 (2007)
From the one-bead-one-compound concept to one-bead-one-reactor
Marani MM, Paradís-Bas M, Tulla-Puche J, Côté S, Camperi SA, Cascone O and Albericio F
J Comb Chem, 9 (3), 395-398 (2007)
Efficient regioselective monobromination of highly activated benzenes
Pla D, Albericio F and Álvarez M
Eur J Org Chem, 12, 1921-1924 (2007)
Chlorotrityl chloride (CTC) resin as a convenient reusable protecting group
García MF, Puxan NB , Cruz LJ, Bohling CJ and Albericio F
QSAR & Comb Sci, 26, 1027-1035 (2007)
Formation of dihydrouracils via cyclization of N-Substituted 3-Thioureidopropanoic acids and facile desulfurization
Carina ML, Delpiccolo, Albericio F, Schiksnis R A and Michelotti EL
, 63, 8949-8953 (2007)
Preparation of penta-azole containing cyclopeptides: challenges in macrocyclization
Hernández D, Riego E, Francesch A, Cuevas C, Albericio F and Álvarez M
Tetrahedron, 63, 9862-9870 (2007)
Beyond azathicoraline sintesis. Synthesis of analogues
Bayó-Puxan N, Fernández A, Tulla-Puche J, Riego E, Álvarez M and Albericio F
Int. J. Peptide Res. Therapeutics, 13, 205-306 (2007)
Chemical synthesis of 19F-labeled HIV-1 protease using fmoc-chemistry and ChemMatrix Resin
Frutos S, Tulla-Puche J, Albericio F and Giralt E
Int. J. Peptide Res. Therapeutics, 13, 221-227 (2007)
Partially fluorinated heterocycles from 4,4-Bis(trifluoromethyl)-hetero-1,3-dienes via C-F bond activation
Burger K, Helmreich B, Henning L, Spengler J, Albericio F and Fuchs A
Monatshefte fuer Chemie/Chemical Monthly, 138, 227-236 (2007)
Novel synthesis of bisaryl acetylenes
Soley R, Albericio F and Álvarez M
Synthesis, 1559-1565 (2007)
Identification of protein-binding peptides by direct MALDI-TOF-MS analysis of peptide beads selected from the screening of one-bead-one peptide combinatorial libraries
Marani MM, Oliveira E, Côte S, Camperi SA, Albericio F and Cascone O
Anal Biochem, 370 (2), 215-222 (2007)
Fmoc-2-mercaptobenzothiazole, for the introduction of the Fmoc moiety free of side-reactions
Isidro-Llobet A, Just-Baringo X, Ewenson A, Alvarez M and Albericio F
Biopolymers, 88, 733-737 (2007)
Simple machine-assisted protocol for solid-phase synthesis of depsipeptides
Spengler J, Koksch B and Albericio F
Biopolymers, 88 (6), 823-828 (2007)
Cell-penetrating proline-rich peptidomimetics
Farrera-Sinfreu J, Giralt E, Royo M and Albericio F
Methods Mol Biol, 386, 241-267 (2007)
Cell-penetrating cis-gamma-amino-l-proline-derived peptides
Farrera-Sinfreu J, Giralt E, Castel S, Albericio F and Royo M
J Am Chem Soc, 127 (26), 9459-9468 (2007)
Beyond azathiocoraline: synthesis of analogues
Bayo-Puxan N, Fernandez A, Tulla-Puche J, Riego E, Alvarez M and Albericio F
International Journal of Peptide Research and Therapeutics, 13, 295-306 (2007)
Total solid-phase synthesis of marine cyclodepsipeptide IB-01212
Cruz LJ, Cuevas C, Cañedo LM, Giralt E and Albericio F
J Org Chem, 71 (9), 3339-3344 (2006)
IB-01212, a new cytotoxic cyclodepsipeptide isolated from the marine fungus Clonostachys sp. ESNA-A009
Cruz LJ, Insua MM, Baz JP, Trujillo M, Rodriguez-Mias RA, Oliveira E, Giralt E, Albericio F and Cañedo LM
J Org Chem, 71 (9), 3335-3338 (2006)
A semicarbazide resin for the solid-phase synthesis of peptide ketones and aldehydes
Vázquez J and Albericio F
Tetrahedron Lett, 47, 1657-1661 (2006)
Peptide Dendrimers
Crespo L, Sanclimens G, Pons M, Giralt E, Royo M, and Albericio F
Chemical Reviews, 105 (5), 1663-1682 (2005)
A Straightforward Preparation of De Novo Globular Proteins Based on Proline Dendrimers
Sanclimens G, Crespo L, Giralt E, Albericio F and Royo M
J Org Chem, 70, 6274-6281 (2005)
Cell-penetrating cis-gamma-amino-l-proline-derived peptides
Farrera-Sinfreu J, Giralt E, Castel S, Albericio F and Royo M
J Am Chem Soc, 127 (26), 9459-9468 (2005)
A new strategy for solid-phase depsipeptide synthesis using recoverable building blocks
Albericio F, Burger K, Ruíz-Rodríguez J and Spengler J
Org. Lett., 7 (4), 597-600 (2005)
Solid-phase syntheses of furopyridine and furoquinoline systems
Cironi P, Tulla-Puche J, Barany G, Albericio F and Alvarez M
Organic Lett, 6 (9), 1405-1408 (2004)
Solid-phase synthesis of second-generation polyproline dendrimers
Sanclimens G, Crespo L, Giralt E, Royo M and Albericio F
Biopolymers, 76 (4), 283-297 (2004)
Developments in peptide and amide synthesis
Albericio F
Curr Opin Chem Biol, 8 (3), 211-221 (2004)
From production of peptides in milligram amounts for research to multi-tons quantities for drugs of the future
Bruckdorfer T, Marder O and Albericio F
Curr Pharm Biotechnol, 5 (1), 29-43 (2004)
A new class of foldamers based on cis-gamma-amino-L-proline
Farrera-Sinfreu J, Zaccaro L, Vidal D, Salvatella X, Giralt E, Pons M, Albericio F and Royo M
J Am Chem Soc, 126 (19), 6048-6057 (2004)
Solid-phase combinatorial synthesis of peptide-biphenyl hybrids as calpain inhibitors
Montero A, Albericio F, Royo M and Herradón B
Org Lett, 6 (22), 4089-4092 (2004)
Qualitative colorimetric tests for solid phase synthesis
Vázquez J, Qushair G and Albericio F
Methods Enzymol, 369, 21-35 (2003)
Synthesis and SAR of alpha-acylaminoketone ligands for control of gene expression
Tice CM, Hormann RE, Thompson CS, Friz JL, Cavanaugh CK, Michelotti EL, Garcia J, Nicolas E and Albericio F
Bioorg Med Chem Lett, 13 (3), 474-478 (2003)
Bicyclic homodetic peptide libraries: comparison of synthetic strategies for their solid-phase synthesis
Teixido M, Altamura M, Quartara L, Giolitti A, Maggi CA, Giralt E and Albericio F
J Comb Chem, 5 (6), 760-768 (2003)
Solid-phase total synthesis of the pentacyclic system lamellarins U and L
Cironi P, Manzanares I, Albericio F and Alvarez M
Organic Lett, 5 (16), 2959-2962 (2003)
Tentoxin as a scaffold for drug discovery. Total solid-phase synthesis of tentoxin and a library of analogues
Jiménez JC, Chavarría B, López-Macià A, Royo M, Giralt E and Albericio F
Organic Lett, 5 (12), 2115-2118 (2003)
Solid-phase synthesis of the cyclic lipononadepsipeptide [N-Mst(Ser1), d-Ser4, L-Thr6, L-Asp8, L-Thr9]syringotoxin
Bayó N, Jiménez JC, Rivas L, Nicolás E and Albericio F
Chemistry, 9 (5), 1096-1103 (2003)
Química combinatòria per al descobriment de nous compostos
Fernando Albericio
Investigador Principal
Professor (Organic Chemistry Dept. - UB)
Tel Oficina : +34 93 403 70 88
Tel Lab : +34 93 4037087-+34 93 4037069
correu-e : fernando.albericio
irbbarcelona.org
Managing Director
Mercedes Álvarez
tel +34 93 403 70 86
mercedes.alvarez
irbbarcelona.org
Postdoctoral Fellow
Frank Sicherl
frank.sicherl
irbbarcelona.org
Jan Spengler
tel +34 93 403 71 27
jan.spengler
irbbarcelona.org
Judit Tulla
tel +34 93 403 48 69
judit.tulla
irbbarcelona.org
Svetlana Savina
tel +34 93 403 78 07
fax +34 93 403 71 26
MSc Student
Marc Martí Terrer
tel +34 93 403 70 87
marc.marti
irbbarcelona.org
PhD Student
Tommaso Cupido
tel +34 93 403 71 27
tommaso.cupido
irbbarcelona.org
Josep Farrera
tel +34 93 403 70 87
josep.farrera
irbbarcelona.org
Fayna García
tel +34 93 403 48 69
fayna.garcia
irbbarcelona.org
Yésica García
tel +34 93 403 48 69
yesica.garcia
irbbarcelona.org
Delia Hernández
tel +34 93 403 70 87
delia.hernandez
irbbarcelona.org
Letícia Hosta
tel +34 93 403 48 69
leticia.hosta
irbbarcelona.org
Albert Isidro
tel +34 93 403 71 27
albert.isidro
irbbarcelona.org
Carles Mas
tel +34 93 403 48 69
carles.mas
irbbarcelona.org
Marta Pelay
marta.pelay
irbbarcelona.org
Daniel Pla
tel +34 93 403 70 87
daniel.pla
irbbarcelona.org
Elisabet Prats
tel +34 93 403 48 69
elisabet.prats
irbbarcelona.org
Javier Ruiz
tel +34 93 403 71 27
javier.ruiz
irbbarcelona.org
Lorena Simón
tel +34 93 403 48 69
lorena.simon
irbbarcelona.org
Angela Graciela Torres
tel +34 93 403 71 20
angela.torres
irbbarcelona.org
Gemma Vilar
tel +34 93 403 70 87
gemma.vilar
irbbarcelona.org
Carles Ayats
tel +34 93 403 70 87
carles.ayats
irbbarcelona.org
Ramón Subiros Funosas
tel +34 93 403 71 27
ramon.subiros
irbbarcelona.org
Pau Ruiz Sanchís
tel +34 93 403 70 87
pau.ruiz
irbbarcelona.org
Xavier Just Baringo
tel +34 93 403 70 87
xavier.just
irbbarcelona.org
Peter Fransen
tel +34 93 403 71 27
peter.fransen
irbbarcelona.org
Project Manager
Eva Poca
tel +34 93 403 71 24
eva.poca
irbbarcelona.org
Research Assistant
Gerardo Alexis Acosta
tel +34 93 403 70 87
gerardo.acosta
irbbarcelona.org
Marta Paradís
tel +34 93 403 48 69
mparadis
pcb.ub.es
Miriam Góngora Benitez
tel +34 93 403 48 69
miriam.gongora
irbbarcelona.org
Visiting Professor
Sukhendu Dev
ken.dev
irbbarcelona.org