• Aumenta el tamaño del texto
  • Disminuye el tamaño del texto
  • Imprimir
  • Envia

Programes de Recerca

Biologia Estructural i Computacional

Modelització molecular i bioinformàtica

morozco

Modesto Orozco

Investigador Principal
Professor (Biochemistry and Molecular Biology Dept. - UB)

Tel Oficina : +34 93 403 71 56
Tel Lab : +34 93 403 71 55
correu-e : modesto.orozcoarrobairbbarcelona.org

Camps d'Investigació

Centrem la nostra recerca en l’estudi dels processos de reconeixement cel·lular d’importància biològica, tant des del punt de vista metodòlogic com aplicacional. Els temes principals són les estructures no estàndard dels àcids nucleics, les propietats dinàmiques de les macromolècules i el reconeixement proteïna-lligand i proteïna-proteïna.

Línies de Recerca

Aspectes metodològics

  • Anàlisi de l’efecte del solvent en el reconeixement molecular. Es comparen mètodes continus i mètodes basats en simulacions amb solvent explícit.
  • Ajustament de la parametrització de simulacions de dinàmica molecular.

Estudis en models petits

  • Estudis teòrics en sistemes model petits de gran impacte biològic. Inclou, entre d’altres, processos tautomèrics i isomerisme, interaccions d’apilament, interaccions electrostàtiques i enllaços d’hidrogen, interaccions π-catió i els mecanismes generals de reconeixement molecular.

Estudis en proteïnes

  • Estudiem la base de les interaccions de les proteïnes, incloent-hi les de rellevància farmacològica. A banda, desenvolupem mètodes per a examinar tant el reconeixement proteïna-proteïna com proteïna-lligand.
  • Analitzem la flexibilitat de la proteïna utilitzant simulacions de dinàmica molecular.

Estudis en àcids nucleics

  • Utilitzem dinàmica molecular i mecànica estadística per a examinar les formes anòmales dels àcids nucleics. Centrem una atenció especial en l’estudi de les transicions conformacionals en l’ADN, les interaccions entre fàrmacs i l’ADN, i l’anàlisi d’hèlixs triples i altres estructures d’impacte potencial en teràpies antigen i antisens.

Bioinformàtica

  • Anàlisi de dades sobre l’ADN genòmic per a identificar les regions amb estructures inusuals o amb propietats mecàniques no convencionals.
  • Desenvolupament d’algorismes per a la predicció del caràcter patològic dels polimorfismes de nucleòtids simples.

Estudi estructural d'splicing en proteïnes

Finançament

Aquest grup de recerca rep finançament de les següents institucions:

  • Fundación Ramón Areces
  • Ministerio de Educación y Ciencia
  • Fundación BBVA
  • CIRIT – Generalitat de Catalunya
Més informació

Recerca de publicacions científiques

Recerca de publicacions científiques


  • Generalitat de catalunya
  • Generalitat de catalunya. Salut
  • Universidad de Barcelona
  • Parc cientific

Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona)
Parc Científic de Barcelona
C/ Baldiri Reixac 10-12
08028 Barcelona - Espanya
Tel: (+34)93 403 7111 | Fax: +34 93 403 7114
infoarrobairbbarcelona.org