Images
Científics de l'IRB Barcelona desenvolupen una estratègia computacional per proteïnes potencials regulats per la quinasa Aurora A.
La quinasa Aurora A, un oncogèn, està involucrada en la regulació dels aspectes clau del cicle cel.lular. No obstant això, se sap molt poc de com aquesta proteïna realitza les seves moltes funcions cel.lulars i les proteïnes a les que regula, etc. Un equip de l'IRB Barcelona, liderat per l'investigador ICREA Patrick Aloy ha desenvolupat, en col.laboració amb el Centre de Regulació Genòmica, una estratègia computacional per identificar noves molècules regulades per fosforilació per Aurora A. El treball s'ha publicat a EMBO reports, una prestigiosa revista del Nature Publishing Group.
Aurora A pertany a un grup de proteïnes que s'encarreguen de regular l'activitat d'altres, controlant així les funcions més bàsiques de les cèl.lules. "Només es coneixen 17 proteïnes a les que modula i aquestes no poden explicar totes les funcions que se li coneixen", explica Patrick Aloy. Per això, aquests investigadors van abordar la qüestió dissenyant una estratègia computacional per buscar possibles dianes d'aquesta proteïna. L'eina consisteix en fer passar les molècules per "filtres" virtuals, que seleccionen les que presenten característiques que els permetrien interaccionar i ser fosforilades per Aurora A. Van trobar 90 candidats possibles i d'aquests van escollir 10 a l'atzar per comprovar les seves prediccions en sistemes biològics. El resultat va ser que 8 d'aquestes molècules realment interaccionaven amb la proteïna d'estudi, el que significa que el seu mètode de predicció té una fiabilitat del 80%.
Conèixer bé les diferents funcions d'aquesta proteïna té una gran importància ja que s'ha vist que Aurora A està sobre-expressada en alguns tipus de càncer. A més, en cas que existeixi el càncer, aquests nivells elevats estan associats a un mal pronòstic de la malaltia. Fa temps que es treballa en la recerca de fàrmacs que bloquegin l'acció d'Aurora A i de fet ja hi ha diferents compostos terapèutics que s'està provant en assaigs clínics en humans. La identificació de substrats d'Aurora A presentats en aquest estudi, contribuiran a contextualitzar les seves funcions i a entendre millor els possibles efectes secundaris provocats per la seva inhibició.
Article de referència:
Uncovering new substrates for Aurora A kinase.
Teresa Sardon, Roland A Pache, Amelie Stein, Henrik Molin, Isabelle Vernos & Patrick Aloy.
EMBO Reports (2010, 11(12): 977-984) [DOI: 10.1038/embor.2010.17]
IRB Barcelona
L’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) treballa per aconseguir una vida lliure de malalties. Desenvolupa una recerca multidisciplinària d’excel·lència per curar el càncer i altres malalties vinculades a l'envelliment. Treballa establint col·laboracions amb la indústria farmacèutica i els principals hospitals per fer arribar els resultats de la recerca a la societat a través de la transferència de tecnologia, i du a terme diferents iniciatives de divulgació científica per mantenir un diàleg obert amb la ciutadania. L’IRB Barcelona és un centre internacional que acull al voltant de 400 investigadors de més de 30 nacionalitats. Reconegut com a Centre d'Excel·lència Severo Ochoa des de 2011, és un centre CERCA i membre del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).
