Images
Participants
Contact
- El projecte MDDB compta amb un finançament de 3,3 milions d'euros i té una durada prevista de tres anys.
- A més de l'IRB Barcelona, el projecte compta amb la col·laboració de l'European Molecular Biology Laboratory, el Barcelona Computing Center, el KTH Royal Institute of Technology, la biotech Nostrum Biodiscovery, el Swiss Federal Institute of Technology in Lausanne i la Universitat d'Oxford.
- La reunió d'inici del projecte va tenir lloc els dies 24 i 25 d'abril a Barcelona
La simulació de dinàmiques moleculars és un mètode computacional emprat en biologia per estudiar el comportament de molècules i sistemes complexos. La informació obtinguda a partir d'aquestes simulacions es pot Fer servir per entendre una gran varietat de fenòmens, com ara la formació de les proteïnes, la interacció entre les molècules o la dinàmica de les reaccions químiques. És un camp de recerca emergent que està generant una gran quantitat de coneixement, però, tot i això, encara no existeix una base de dades unificada que agrupi i emmagatzemi aquestes dades de manera accessible i sistematitzada.
Investigadors encapçalats pel Dr. Modesto Orozco, cap del laboratori de Modelització Molecular i Bioinformàtica de l'IRB Barcelona, han posar en marca un projecte per dissenyar una base de dades europea de dinàmiques moleculars. Durant els propers tres anys, els científics ausentaran les bases per a la creació d'una infraestructura que optimitzi els recursos computacionals, afavoreixi l'anàlisi de dades des de diferents perspectives, garanteixi un intercanvi ràpid i eficient d'informació entre diferents institucions i faciliti la integració de les dinàmiques moleculars en altres àrees de recerca.
Els dies 24 i 25 d'abril es va celebrar a Barcelona la reunió inaugural del projecte, a la qual van assistir representants de totes les institucions que componen el consorci: el Barcelona Computing Center (BSC CNS), l'European Bioinformatics Institute de l'EMBL (EMBL-EBI), el KTH Royal Institute of Technology d'Estocolm (KTH), la spin-off Nostrum Biodiscovery, el Centre Européen de Calcul Atomique et Moleculaire (CECAM) de la Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL) i la Universitat d'Oxford (UOXF), a més de l'IRB Barcelona.
Aquesta reunió inaugural servirà per detallar el pla d’acció per als propers tres anys, compartir coneixement estratègic i definir accions per involucrar la comunitat científica experta en el camp de les dinàmiques moleculars.
Per tal de garantir el desenvolupament d'una infraestructura estable a llarg termini, el consorci MDDB reuneix centres de dades i de computació d'alt rendiment, representants de la comunitat de simulació de dinàmica molecular i experts en la gestió de dades i operació de bases de dades. KTH és el desenvolupador de programari més important d’Europa, mentre que l’IRB Barcelona, Nostrum Biodiscovery, BSC-CNS, KTH I UOXF són grans productors i usuaris de dades de dinàmica molecular. A més, l’IRB Barcelona, UOXF, Nostrum Biodiscovery i el BSC-CNS, van ser els desenvolupadors dels primers prototips de bases de dades de dinàmica molecular. L’EMBL-EBI aporta la seva àmplia experiència en el desenvolupament i l'operació de bases de dades biològiques de referència i CECAM-EPFL aglutina les diferents comunitats facilitant l'intercanvi d'informació que permeti desenvolupar una base de dades que respongui a les necessitats dels usuaris.
La creació duna base de dades de dinàmica molecular podria tenir un gran impacte en la recerca en àrees com la bioquímica, la farmacologia, la medicina personalitzada, la química o la nanotecnologia. "El projecte MDDB que llancem avui és una prova de concepte i esperem que estableixi els fonaments perquè una futura infraestructura que reuneixi els resultats de simulació molecular i els integri a l'ecosistema de dades que mou la biologia actual", explica el Dr. Orozco , també catedràtic del Departament de Bioquímica i Biomedicina de la Universitat de Barcelona.
El projecte compta amb un finançament de 3,3 milions d'euros (dels quals 2,6M€ obtinguts del programa Horizon Europe de la Comissió Europea, 0,35M€ aportats per l'agència anglesa UK Research and Innovation i 0,34M€ per la suïssa (State Secretariat for Education, Research and Innovation), tindrà una durada de tres anys i espera aconseguir el suport necessari per ser considerada una infraestructura estratègica als plans nacionals i europeus.
Aquest projecte ha obtingut finançament del programa Horizon de la Unió Europea (grant agreement 101094651).
IRB Barcelona
L’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) treballa per aconseguir una vida lliure de malalties. Desenvolupa una recerca multidisciplinària d’excel·lència per curar el càncer i altres malalties vinculades a l'envelliment. Treballa establint col·laboracions amb la indústria farmacèutica i els principals hospitals per fer arribar els resultats de la recerca a la societat a través de la transferència de tecnologia, i du a terme diferents iniciatives de divulgació científica per mantenir un diàleg obert amb la ciutadania. L’IRB Barcelona és un centre internacional que acull al voltant de 400 investigadors de més de 30 nacionalitats. Reconegut com a Centre d'Excel·lència Severo Ochoa des de 2011, és un centre CERCA i membre del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).
