10 cèl·lules són suficients per a realitzar estudis fiables d'activitat gènica

Els resutats obtinguts amb el mètode "Pico Profiling" són similars als obtinguts mitjançant altres mètodes que fan servir més cèl·lules. PLoS ONE
Els resutats obtinguts amb el mètode "Pico Profiling" són similars als obtinguts mitjançant altres mètodes que fan servir més cèl·lules. PLoS ONE

Descriuen un nou mètode que permet l’anàlisi de l’expressió gènica de cèl·lules poc abundants als organismes.

Científics de l'IRB Barcelona desenvolupen un nou mètode, anomenat "Pico Profiling", que permet per primer cop una anàlisi de l’activitat gènica fiable i complerta a partir de mostres que contenen un petit número de cèl·lules. El treball, liderat per Herbert Auer, cap de la Plataforma Científica de Genòmica Funcional de l'IRB Barcelona, i que ha comptat amb la col·laboració d’investigadors del laboratori MetLab de l'IRB Barcelona i de la Ohio State University, permetrà l’estudi en profunditat de cèl·lules difícils d’obtenir degut a la seva poca abundància a l’organisme. L’article s’ha publicat a PLoS ONE, revista internacional que tracta de les disciplines relacionades amb la ciència i la medicina.

Totes les cèl·lules funcionen copiant la informació continguda als gens, de manera que alteracions en l’activitat gènica poden provocar desordres greus en el funcionament cel·lular i fins i tot ser causa de malalties. L’anàlisi detallat de l’activitat dels gens, a través dels perfils d’expressió gènica, és una de les estratègies més completes per a l’estudi del funcionament de les cèl·lules i el seu comportament durant el desenvolupament d’una malaltia. Mentre que els mètodes convencionals d’anàlisi d’expressió gènica són eficaços per a un gran nombre de poblacions cel·lulars, el fet que necessitin milions de cèl·lules dificulta l’estudi d’aquelles poblacions poc freqüents, com les cèl·lules metastàsiques, les cèl·lules mare o les cèl·lules embrionàries . "En el cas de les cèl·lules mare hematopoètiques (aquelles que formen les cèl·lules de la sang) de ratolí, hauríem de sacrificar centenars d’animals per poder tenir prou material per a l’anàlisi de l’expressió gènica mitjançant els mètodes convencionals" explica Auer.

En aquest treball els investigadors desenvolupen un nou mètode d’anàlisi d’activitat gènica que permet l’estudi de només 10 cèl·lules i fins i tot cèl·lules individuals, material un milió de vegades menor al que necessiten els mètodes convencionals. Aquest nou mètode, que introdueix canvis en els processos d’obtenció del material biològic i de la seva posterior multiplicació, ofereix resultats reproduïbles i similars als obtinguts mitjançant les tècniques convencionals, que utilitzen un major número de cèl·lules. "Anteriorment s’havien descrit metodologies per a l’estudi de l’expressió gènica a partir d’un nombre reduït de cèl·lules, però nosaltres hem demostrar que la meitat dels seus resultats no representa el que realment passa a la natura", diu Auer.

Un repte de la biomedicina actual és aconseguir informació fiable a partir de poblacions cel·lulars poc freqüents. El treball desenvolupat per Auer ofereix per primera vegada la possibilitat d’estudiar d’una forma exacta el comportament d’algunes d’aquestes cèl·lules, com per exemple les cèl·lules metastàsiques, que són les responsables del 90% de les morts per càncer.

Article de referència:
Accurate expression profiling of very small cell populations
Eva Gonzalez-Roca, Xavier Garcia-Albéniz, Silvia Rodriguez-Mulero, Roger R. Gomis, Karl Kornacker, and Herbert Auer.
PLoS One (2010) [doi: 10.1371/journal.pone.0014418]