La Fundación ”la Caixa” apuesta por el aprendizaje automático para potenciar el éxito de las inmunoterapias del cáncer

La convocatoria CaixaResearch de Investigación en Salud 2022 ha seleccionado 33 nuevos proyectos biomédicos y de salud prometedores en centros de investigación y universidades de España y Portugal. De esta manera, la Fundación ”la Caixa” reafirma una vez más su apoyo a proyectos de excelencia que puedan impactar de forma positiva en la salud de los ciudadanos.

Para ello, la entidad dota con un total de 23,1 millones de euros estos proyectos ―20 de ellos, españoles, y 13, portugueses―, que deberán desarrollarse durante los próximos tres años.

Uno de los proyectos financiados está liderado por el Dr. Fran Supek, investigador ICREA y jefe del laboratorio Genome Data Science del IRB Barcelona, y está orientado a buscar nuevas estrategias terapéuticas, utilizando el aprendizaje automático para mejorar la eficacia de la inmunoterapia en el tratamiento del cáncer. El proyecto se llevará a cabo en colaboración con la Dra. Ana Janic en la Universidad Pompeu Fabra (UPF).

Otro de los proyectos, en el cual participará el laboratorio de Genómica Biomédica, que dirige la investigadora ICREA Dra. Núria López-Bigas en el IRB Barcelona, estará coordinado por el Dr. José Javier Fuster en el Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III – CNIC. El proyecto se centrará en la búsqueda de nuevos biomarcadores para la progresión de la insuficiencia cardíaca.

En esta edición, se ha premiado a nueve proyectos liderados por investigadores de centros de investigación catalanes, 3 de ellos del Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS) y uno de cada uno de los siguientes centros: Institut d’Investigació contra la Leucèmia Josep Carreras; Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona (IRB Barcelona); Vall d’Hebron Institut d’Investigació (VHIR); Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa; Universitat Pompeu Fabra (UPF) e Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (IMIM-Hospital del Mar).

Además, diversos proyectos de los 33 seleccionados cuenta con participación catalana desde los siguientes centros: Centro de Regulación Genómica (CRG); Fundació Privada per a la Recerca i la Docència Sant Joan de Déu; EMBL Barcelona; Universitat Autònoma de Barcelona; Fundación Lucha contra las Infecciones; Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries – IRTA; Institut d'Investigació Biomèdica de Girona, Universitat de Girona; i Fundació Institut d’Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP).

Entre los elegidos hay proyectos para lograr un nuevo tratamiento para las encefalitis autoinmunes; analizar cómo influye la microbiota intestinal en la pérdida de control de la ingesta en la obesidad; averiguar cómo modulan las células tumorales el microambiente que las rodea para que les sea favorable; y desarollar una nueva nanotecnología terapéutica para detener la progresión del párkinson o regenerar el tejido cardiaco tras un infarto, entre otros.

Una nueva aproximación para potenciar el éxito de las inmunoterapias del cáncer

• Investigador principal: Fran Supek, del Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona (IRB Barcelona)
• Proyecto en consorcio con: Ana Janic, de la Universitat Pompeu Fabra (UPF)
• Subvención: 998.900,50 euros

A pesar de que la inmunoterapia ha supuesto una auténtica revolución de los tratamientos del cáncer, solo 2 de cada 10 pacientes se benefician de ella. Y sigue siendo un desafío total identificar a esos pacientes antes de iniciar la administración del tratamiento.

Una pista la da el número de mutaciones, que puede señalar si un determinado tumor es o no tratable con inmunoterapia. Eso sugiere que las proteínas mutadas pueden ser detectadas por el sistema inmunitario. También se sabe que las células humanas tienen un mecanismo de vigilancia que les permite silenciar la expresión de proteínas mutadas.

En este proyecto, los investigadores parten de la hipótesis de que, si apagan este mecanismo de vigilancia en las células cancerosas, se podrían activar muchas mutaciones, lo que, a su vez, produciría más proteínas mutadas, que harían que el tumor fuera visible para el sistema inmunitario y tratable con inmunoterapia.

Usando modelos animales de cáncer de pulmón y linfoma, tratarán de probar esta hipótesis. Su objetivo es allanar el camino para futuros estudios que investiguen la administración de fármacos inhibidores de este mecanismo con la finalidad de mejorar la perspectiva de las inmunoterapias.

Identificando nuevos biomarcadores para la progresión de la insuficiencia cardíaca

• Investigador principal: José Javier Fuster, del Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III – CNIC
• Proyecto en consorcio con: Nuria Lopez-Bigas, ICREA - Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona); Antoni Bayés Genís, de la Fundació Institut d’Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP); Domingo Andrés Pascual Figal, de la Fundación para la Formación e Investigación Sanitarias de la Región de Murcia, y Manel Esteller Badosa, de la Fundació Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras (Institut Josep Carreras)
• Subvención: 998.043,28 euros

Hasta hace poco, se consideraba que la adquisición de mutaciones en las células madre que dan origen a las células sanguíneas solo era relevante para el cáncer. No obstante, cada vez hay más evidencias que señalan que es también una marca distintiva del envejecimiento. De hecho, diversos estudios realizados en humanos han demostrado que las personas que tienen unas mutaciones determinadas en las células sanguíneas, un fenómeno llamado hematopoyesis clonal, presentan altas tasas de mortalidad debido, fundamentalmente, a la enfermedad cardiovascular.

En este sentido, se ha visto que existe una relación entre esas mutaciones y el desarrollo de insuficiencia cardíaca, una patología en la que el corazón no bombea la sangre de manera eficiente.

El proyecto colaborativo MyoClonal combinará estudios en humanos y en ratones con el objetivo de comprender mejor la relevancia de la hematopoyesis clonal en la enfermedad cardiovascular. Los investigadores estudiarán en profundidad el efecto de distintas mutaciones adquiridas en células sanguíneas sobre la insuficiencia cardíaca. El conocimiento que generen permitirá tratar mejor a los pacientes con esta patología, los cuales suelen requerir hospitalizaciones frecuentes y presentan un riesgo elevado de muerte.