Images
Científics de l’IRB Barcelona obren la porta a descriure les conformacions de les proteïnes sense estructura definida
Les tècniques estructurals i teòriques uneixen forces per desenvolupar noves metodologies per a l’anàlisi de les proteïnes
Investigadors del programa conjunt de l’IRB Barcelona i el Barcelona Supercomputing Center (BSC) han descobert una nova manera d’estudiar la forma de les proteïnes. L’estudi ha estat liderat pel Modesto Orozco, cap de grup del laboratori de Modelització Molecular i Bioinformàtica, i el Xavier Salvatella, cap de grup del laboratori de Biofísica Molecular, ambdós investigadors ICREA a l'IRB Barcelona. Segons Orozco, també catedràtic de la Universitat de Barcelona i director del Departament de Ciències de la Vida del BSC, “gràcies a combinar mètodes de simulació molecular per ordinador amb tècniques fisicoquímiques experimentals, hem pogut esbrinar l’estructura de proteïnes per les quals abans existien obstacles tècnics”. Els resultats estan disponibles a partir d’avui a la versió electrònica de la prestigiosa revista Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).
Aquesta recerca desenvolupada a l’IRB Barcelona, presenta un avenç en la investigació de l’estructura de les proteïnes. En paraules de la primera autora, l’estudiant de doctorat italiana Michela Candotti, “saber la forma que adopten les proteïnes és vital per poder-ne fer qualsevol estudi. No és el mateix que un filferro agafi la forma d’un clip, d’una grapa o d’una molla”. Això és especialment rellevant quan una mateixa proteïna pot fer vàries funcions.
L’estudi en qüestió té varies implicacions científiques que es poden resumir en els següents tres punts. En primer lloc, els investigadors han pogut descriure els mecanismes químics pels quals les proteïnes es despleguen en presència de compostos com la urea. En paraules d’Orozco, “aquest era un debat que estava obert des dels anys 60 i que amb aquest treball es pot considerar tancat”. Per altra banda, han establert una nova estratègia experimental que permetrà descobrir la conformació de les Proteïnes Intrínsecament Desordenades (PID). Les PID són un grup de proteïnes sense una estructura rígida i representen una part important del proteoma de la qual se’n sap molt poques coses. “Els nostres resultats podran ajudar en la recerca sobre malalties on les PID estiguin implicades, com el càncer, el Parkinson o l’Alzheimer”, explica Salvatella. Finalment, han descobert quins són els primers passos en el plegament de les proteïnes, un aspecte també objecte de moltes discussions.
Article de referència:
Towards an atomistic description of the urea-denatured state of proteins
Michela Candotti, Santiago Esteban-Martín, Xavier Salvatella and Modesto Orozco
Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) (2013) online Early Edition the week of March 25.
IRB Barcelona
L’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) treballa per aconseguir una vida lliure de malalties. Desenvolupa una recerca multidisciplinària d’excel·lència per curar el càncer i altres malalties vinculades a l'envelliment. Treballa establint col·laboracions amb la indústria farmacèutica i els principals hospitals per fer arribar els resultats de la recerca a la societat a través de la transferència de tecnologia, i du a terme diferents iniciatives de divulgació científica per mantenir un diàleg obert amb la ciutadania. L’IRB Barcelona és un centre internacional que acull al voltant de 400 investigadors de més de 30 nacionalitats. Reconegut com a Centre d'Excel·lència Severo Ochoa des de 2011, és un centre CERCA i membre del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).
