Vés al contingut

L’IRB Barcelona col·labora amb Amazon per desenvolupar una eina computacional que acceleri la cerca de fàrmacs contra la COVID-19

Científiques
3 abr. 20

Images

Participants

Imatge
Visiting Student
Tel.+34 93 40 39689

Contact

Imatge
Communication Officer
Tel.+34 93 40 37255

·      L’eina està basada en la tecnologia Chemical Checker, desenvolupada pel Laboratori de Bioinformàtica Estructural i Biologia de Xarxes de l’IRB Barcelona.

·      L’objectiu és generar, mitjançant intel·ligència artificial, una base de dades de fàrmacs que incorpori tots els resultats científics publicats en relació al tractament de la COVID-19.

·      La base de dades és de lliure accés i farà accessible a investigadors de tot el món un registre ampliat de molècules per lluitar contra la COVID-19.

Actualment hi ha més de 10.000 articles científics relacionats amb infeccions per coronavirus. De fet, en les últimes setmanes, la recerca per combatre la COVID-19 s’ha accelerat i s’han publicat més de 4.000 nous articles acadèmics sobre possibles vacunes, teràpies i tractaments. Processar aquest volum d'informació manualment seria impossible de gestionar per poder avançar amb la urgència necessària en les investigacions. El Laboratori de Bioinformàtica Estructural i Biologia de Xarxes de l’IRB Barcelona, liderat per l’investigador ICREA Patrick Aloy, ha unit forces amb Amazon Barcelona per desenvolupar una eina computacional que acceleri el procés utilitzant intel·ligència artificial capaç de “llegir” tots aquests articles per extreure tota la informació rellevant en relació a les molècules i tractaments estudiats.

A través d’una revisió limitada de la literatura científica més rellevant, els investigadors de l’IRB Barcelona han identificat fins ara més de 150 compostos potencialment actius contra la COVID-19, amb diferents nivells d’evidència experimental. Ara, l’objectiu és trobar altres fàrmacs amb unes característiques similars a aquests que permetin expandir el registre de molècules d’interès i augmentar les possibilitats de aconseguir-ne alguna que sigui altament efectiva. Els resultats ja estan disponibles a: https://sbnb.irbbarcelona.org/covid19/.

“Actualment, el que necessitem és que els grups de recerca que estiguin treballant en tractaments contra la COVID-19 introdueixin els seus resultats”, explica Patrick Aloy. “Les noves molècules s’incorporaran de forma automàtica un cop al dia, i així tota la comunitat científica disposarà de dades actualitzades, que ajudaran a evitar duplicitats i generaran noves hipòtesis de cara a trobar un tractament definitiu”.

 

Una col·laboració veloç al servei del descobriment de fàrmacs

El Chemical Checker és una eina computacional que ofereix informació sobre 1 milió de molècules amb potencial farmacològic. “L’objectiu del Chemical Checker és processar i codificar dades complexes sobre els efectes que diferents compostos químics generen en organismes vius, de forma que puguin ser incorporades en les noves tecnologies d’intel.ligència artificial”, explica Miquel Duran, investigador del grup de l’IRB Barcelona i primer autor del treball.

En poc més de una setmana, el laboratori de Patrick Aloy i el grup d’Amazon Barcelona han establert una col·laboració que ha permès afinar aquesta eina bioinformàtica. “Per a nosaltres ha estat un plaer posar la capacitat de la nostra intel·ligència artificial en processament automàtic del llenguatge natural en els textos al servei del descobriment de posibles fàrmacs contra la COVID-19”, apunta Hugo Zaragoza, d’Amazon Search Science i AI Group.

L’experiència que té Amazon en text-mining, machine learning i en la comprensió del llenguatge natural ha permès incorporar al Chemical Checker a un ritme ràpid l’anàlisi automàtica d’articles científics. “La col·laboració amb Amazon ha estat clau per tenir aquesta eina tan ràpidament. Sense la seva capacitat d’AWS cloud computing i de processament de textos, hagués estat impossible”, afirma Patrick Aloy.

 

L’IRB Barcelona, compromès amb la recerca de la COVID-19

El mateix laboratori de Bioinformàtica Estructural i Biologia de Xarxes també participa en el projecte europeu RiPCoN, centrat en la identificació de les proteïnes humanes que utilitza el virus per a la seva expansió, amb l'objectiu d'identificar fàrmacs (ja en el mercat, o en proves) que puguin modular la seva activitat i frenar-ne la replicació vírica.

L’IRB Barcelona també treballa en altres projectes relacionat amb la COVID-19, com ara el desenvolupament d’un mètode diagnòstic ràpid i senzill per a la detecció del virus. Una altra línia de recerca busca desenvolupar un tractament en esprai per a la COVID-19, i un altre projecte es centra en reduir la mortalitat per la COVID-19 trobant un tractament per la seva principal causa de mortalitat: la síndrome de dificultat respiratòria aguda.

Per obtenir més informació sobre el que Amazon està fent per a clients, comunitats i empleats, visiteu: https://www.aboutamazon.es/amazon-pone-en-marcha-medidas-para-ayudar-a-clientes-comunidades-y-empleados-afectados-por-el-covid-19

L'IRB Barcelona treballa per fer front a la pandèmia de coronavirus, coneix els nostres projectes.

 

Sobre l’IRB Barcelona

Creat el 2005 per la Generalitat de Catalunya i la Universitat de Barcelona, l'IRB Barcelona és Centre d'Excel·lència Severo Ochoa des de 2011. L’objectiu de l’IRB Barcelona és fer recerca d'excel·lència en biomedicina i millorar la qualitat de vida de les persones i, en paral·lel, potenciar la formació de talent, la transferència tecnològica i la comunicació social de la ciència. Els 27 laboratoris i vuit plataformes tecnològiques treballen per respondre a preguntes bàsiques en biologia i orientades a malalties com ara el càncer, la metàstasi, l’Alzheimer, la diabetis i malalties rares. És un centre internacional que acull al voltants de 400 treballadors de més de 30 nacionalitats. Està ubicat en el Parc Científic de Barcelona. L’IRB Barcelona és un centre CERCA i és membre del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).