Vés al contingut

Structural Characterization of Macromolecular Assemblies

Trip Lab
Desactivado
Imatge
Group Leader
Telephone:
+34 93 40 37189

ICREA Research Professor

Imatge
ICREA

Research information

Research interests

Our research interests are focused on deciphering the mechanisms that correlate cell signaling with gene expression applying structural biology (NMR, X-ray and SAXS). With our structures, we aim to describe how biological processes occur, how they are regulated and their implications in human diseases.

A large part of our work has been devoted to clarifying the role of SMAD transcription factors in TGFβ signaling. SMAD proteins are key components of the TGFβ pathway, one of the four conserved pathways in metazoans. In humans, these proteins are involved in a wide range of cellular responses and are mutated in many oncologic, autoimmune and neurological disorders. Our long-term goal is to explain the complete picture of how full-length SMAD proteins transmit TGFβ signaling and regulate gene expression and cell fate in health and disease.

More recently and in collaboration with medical doctors and researchers of the Sant Pau hospital in Barcelona, we are currently studying the probability of relapse and metastasis of gynecological Cancer patients. We contribute with the analysis of patients’ data from biopsies using artificial intelligence.

Research lines

How Smad proteins and bound cofactors assemble and read DNA

Molecular and structural analysis of ribonucleoprotein complexes

Structural and functional characterization of Somatostatin and Cortistatin analogues

Signatures for the prediction of recurrence and metastasis in Endometrial Cancers.

Computer tools for structural biology

 

Selected publications

Martin-Malpartida, P; Arrastia-Casado, S; Farrera-Sinfreu, J; Lucas, R; Fischer, H; Fischer, B; Eaton, DC; Tzotzos, S; Macias, MJ
Computational And Structural Biotechnology Journal
20
2082 -
2090
(2022)
Martin-Malpartida, P; Hausvik, E; Underhaug, J; Torner, C; Martinez, A; Macias, MJ
Journal Of Molecular Biology
434
(11 )
167372 -
(2022)
Gomes, T; Martin-Malpartida, P; Ruiz, L; Aragón, E; Cordeiro, TN; Macias, MJ
Computational And Structural Biotechnology Journal
19
( )
5210 -
5224
(2021)
Freier, R; Aragon, E; Pluta, R; Martin-Malpartida, P; Ruiz, L; Condeminas, M; Gonzalez, C; Macias, MJ
Iucrj
8
(Pt 2 )
281 -
294
(2021)
Rol, A; Todorovski, T; Martin-Malpartida, P; Escolà, A; Gonzalez-Rey, E; Aragón, E; Verdaguer, X; Vallès-Miret, M; Farrera-Sinfreu, J; Puig, E; Fernández-Carneado, J; Ponsati, B; Delgado, M; Riera, A; Macias, MJ
Nature Communications
12
(1 )
1869 -
(2021)
Ruiz, L; Kaczmarska, Z; Gomes, T; Aragon, E; Torner, C; Freier, R; Baginski, B; Martin-Malpartida, P; Garrido, ND; Marquez, JA; Cordeiro, TN; Pluta, R; Macias, MJ
Computational And Structural Biotechnology Journal
19
( )
632 -
646
(2021)
Aragón, E; Wang, Q; Zou, YL; Morgani, SM; Ruiz, L; Kaczmarska, Z; Su, J; Torner, C; Tian, L; Hu, J; Shu, WP; Agrawal, S; Gomes, T; Márquez, JA; Hadjantonakis, AK; Macias, MJ; Massagué, J
Genes & Development
33
(21-22 )
1506 -
1524
(2019)
Martin-Malpartida, P; Batet, M; Kaczmarska, Z; Freier, R; Gomes, T; Aragón, E; Zou, YL; Wang, Q; Xi, QR; Ruiz, L; Vea, A; Márquez, JA; Massagué, J; Macias, MJ
Nature Communications
8
(1 )
2070 -
(2017)
Macias M; Martin-Malpartida P; Massagué J
Trends In Biochemical Sciences
40
(6 )
296 -
308
(2015)
Zhou R; Maisuradze G; Suñol D; Todorovski T; Macias M; Xiao Y; Scheraga H; Czaplewski C; Liwo A
Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America
111
(51 )
18243 -
18248
(2014)
Aragón E; Goerner N; Zaromytidou A; Xi Q; Escobedo A; Massagué J; Macias M
Genes & Development
25
(12 )
1275 -
1288
(2011)

Projects

"Identificación de los sitios de interacción de proteínas Smad con cofactores mediante el uso de biología estructural de alta resolución" (DiSCo-HR), cofinanciado por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades- Agencia Estatal de Investigación y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) de la Unión Europea, una manera de hacer Europa. Referencia: BFU2017-82675-P.

Ministerio de ciencia, innovación y universidades
Agencia estatal de investigación
European union

"Stem cell differentiation and TGFB-SMAD signaling: Structures of Smad2 and FoxH1 bound to the goosecoid promoter. Analysis of the variants and tumor mutations in these interactions" (MaSSMADs), cofinanciado por el Ministerio de Economía y Competitividad y por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) de la Unión Europea. Referencia: BFU2014-53787-P (MINECO/FEDER, UE).

Gobierno de españa
European union

“Indicadors genòmics per a la predicció de la recurrència i la metàstasi en cáncer endometrial”, con el apoyo de la Fundació La Marató de TV3 (201911-30-31).

Fundació La Marató

 

 

 


Suport obtingut de l’FSE a través de les Ajuts per a la contractació de personal investigador novell (FI). El Fons Social Europeu dona suport a la creació d’ocupació, ajuda a las persones a aconseguir millors llocs de treball i garanteix oportunitats laborals més justes per a la ciutadania de la Unió Europea.

FEDER

 

 

 


“El factor de transcripción Smad4 como diana para el descubrimiento de fármacos: aplicaciones en cancer y enfermedades raras” (Drugs4Smad4), cofinanciado por el Ministerio de Ciencia e Innovación - Agencia Estatal de Investigación (AEI) y por la Unión Europea "NextGenerationEU" mediante el Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia (PRTR). PDC2021-121162-I00/MCIN/AEI/10.13039/501100011033/NextGenerationEU/PRTR

Imatge

 

 


Suport obtingut del SOC pel foment a la contractació en pràctiques de joves en situació d'atur, i finançament al 100% pel Fons Social Europeu com a part de la resposta de la Unió Europea a la pandèmia de COVID-19.

Imatge

 

 


Complejos SMAD con un papel esencial en el desarrollo y la progresión del cáncer” proyecto PID2021-122909NB-I00 financiado por MCIN/ AEI /10.13039/501100011033/ y por FEDER Una manera de hacer Europa.

Ministerio de ciencia e innovación, Unión Europea, Agencia estatal de investigación

Group members

Postdoctoral Fellow
PhD Student
PhD Student
Research Assistant
Research Assistant
Research Assistant
Research Assistant
Visiting Student

Group News

Innovació
irbbarcelona
L'IRB Barcelona als mitjans
Científiques